Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms