Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC69A6NI79 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms