Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NEMP2A6NFY4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms