Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GMNCA6NCL1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms