Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
XIRP2A4UGR9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XIRP2A4UGR9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms