Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SSPOA2VEC9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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