Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms