Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MAP3K4Q9Y6R4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms