Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A4Q9Y6R1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms