Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DYNC1LI1Q9Y6G9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms