Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPQQ9Y646 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms