Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FARP1Q9Y4F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FARP1Q9Y4F1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms