Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP15Q9Y4E8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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