Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIGD1AQ9Y241 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms