Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G4CQ9UP65 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLA2G4CQ9UP65 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms