Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1RE1Q9UN81 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms