Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP18Q9UMW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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