Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STRIP2Q9ULQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP2Q9ULQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms