Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ZNF608Q9ULD9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF608Q9ULD9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms