Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH9Q9ULB4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms