Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms