Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGA2Q9UJY4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms