Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms