Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPA4Q9UI42 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPA4Q9UI42 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPA4Q9UI42 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms