Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUF60Q9UHX1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms