Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms