Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
XCL2Q9UBD3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms