Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHPF2Q9P2E5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHPF2Q9P2E5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms