Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMOD4Q9NZQ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMOD4Q9NZQ9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms