Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBP1Q9NZI7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBP1Q9NZI7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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