Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GGA3Q9NZ52 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGA3Q9NZ52 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms