Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP6Q9NYH9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP6Q9NYH9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP6Q9NYH9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP6Q9NYH9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP6Q9NYH9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms