Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM28Q9NW13 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms