Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CISHQ9NSE2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CISHQ9NSE2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms