Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELLSQ9NRZ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms