Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF4Q9NR80 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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