Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GDF3Q9NR23 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF3Q9NR23 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms