Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL3Q9NQ33 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms