Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP2Q9NPB3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CABP2Q9NPB3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP2Q9NPB3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms