Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCB9Q9NP78 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCB9Q9NP78 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms