Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW7

TXNRD2, Thioredoxin reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2Q9NNW7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNRD2Q9NNW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNRD2Q9NNW7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNRD2Q9NNW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNRD2Q9NNW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNRD2Q9NNW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms