Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ5

ZSWIM6, Zinc finger SWIM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM6Q9HCJ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSWIM6Q9HCJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM6Q9HCJ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms