Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3GQ9HC16 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms