Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI0

PARVG, Gamma-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVGQ9HBI0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVGQ9HBI0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVGQ9HBI0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms