Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELL3Q9HB65 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELL3Q9HB65 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms