Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SUDS3Q9H7L9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms