Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA6BQ9H3T3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms