Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK2Q9H0K1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms