Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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HOXD1Q9GZZ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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HOXD1Q9GZZ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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HOXD1Q9GZZ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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HOXD1Q9GZZ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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HOXD1Q9GZZ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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HOXD1Q9GZZ0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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HOXD1Q9GZZ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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