Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCSER1Q9C0I3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCSER1Q9C0I3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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